ChimerMarker GeneMarker フラグメント解析

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STR(Short Tandem Repeat)-PCR法キメリズム解析

/ Maternal Cell Contamination(MCC)解析ソフトウェア

STR(Short Tandem Repeat)-PCR法キメリズム解析ソフトウェアChimerMarker (キメラマーカー)は、同社製DNAフラグメント解析ソフトウェアGeneMarker(ジーンマーカー)をベースにした、STR-PCR法キメリズム解析に特化したDNAフラグメント解析ソフトウェアです。アロジェニックもしくは自家両方の幹細胞移植造血幹細胞移植骨髄移植末梢血幹細胞移植後サンプルでのキメリズムレベルを定量的にモニタリングするために使用することができます。移植前ドナー、レシピエントサンプルのSTRデータからキメリズム解析用パネル(Chimertyping Panel)をソフトウェアが自動で作成し、移殖後サンプルデータからドナー由来ピークとレシピエント由来ピークを自動検出します。ドナーとレシピエントで共通するアレルは自動的に無視され、識別可能なアレルを用いて解析が行われます。ChimerMarkerソフトウェアにより正確かつ迅速なジェノタイピングとキメリズム解析が可能です;

ChimerMarker ソフトウェアは、タイムポイントにおけるサンプル間比較に基づく個別モニタリングのための経時解析レポートや包括括的キメリズム解析レポートなどの作成が可能です。キメリズム解析はDr. Don Kristtの手法を使用した反復計算を行います。またMaternal Cell Contamination (MCC) アプリケーションにも対応しています。ABI®PRISMなどのジェネティックアナライザー、Identifiler®PowerPlex®16PowerPlex®ESIを含むSTRジェノタイピング用ケミストリー(カスタムプライマーまたは各社カタログケミストリー)に対応しています。ジェノタイピングソフトウェアからキメリズム解析ソフトウェアへのデータ移行など間違えやすいステップが無いため、容易かつ完全にジェノタイピングからキメリズム解析へと連携できます。

動作環境

PC

​OS:Windows®   32 or 64 bit OS: Vista, 7, 8 , 10
CPU:シングルコア以上
動作メモリ:2GB RAM
必要HDD容量:20 GB 空き容量

Intel® Powered Macintosh Computer
OS: 10.4.6(要 Parallels desktop for MAC

もしくは Apple Boot Camp)
Windows®   32 or 64 bit OS
動作メモリ:2GB RAM
必要HDD容量:20 GB 空き容量

※本製品は研究用です。研究用以外の目的で使用しないでください。

記載の社名および製品名は、SoftGenetics社または各社の商標または登録商標です。

アプリケーションノート:

  • 移殖後サンプルのSTR(Short Tandem Repeat)に基づく自動キメリズム解析(キメリズム検出、定量、モニタリング)(PDF)

  • ChimerMarkerを用いた自動キメリズム解析 (PDF)

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