Mutation Surveyor ソフトウェアでは、リシーケンス、ダイレクトシーケンス、PCRシーケンス、ミトコンドリアDNAシーケンスプロジェクトなどサンガーシーケンスプロジェクトのための独自のレポーティングオプションが利用できます。様々な目的のために使用できるカスタムレポートが搭載されており、サンプルのグルーピング方法から、表示するMutationタイプの選択まで、様々なカスタマイズが可能です。レポーティングオプションや情報の編成オプションにより、以下のことが行えます；

• サンプル/患者ファイルを再編成する。

• 特定のバリアント（Homozygous/Heterozygous、Silent/Missense/Nonsense、Reported/Unreportedなど）を指定して表示する。

• 各Pathogenicityの色の設定を行う。

• 全領域もしくは翻訳領域やROI（Region of Interest）領域などバリアントコールする領域を指定する。

• トレースのクオリティ情報を付加する。

• バリアント表記法（ゲノミック、cDNA/CDS、mRNA、HGVS、カスタム）を指定する。

レポートには、あるポジションにおける潜在的な変異アレルのContributionに対するノーマルアレルのContributionを示す、独自のNormal Allele Scoring法（NM_Score）が含まれます。SNPsやホモ接合Indels、ヘテロ接合Indels、低頻度バリアント（体細胞バリアント、ヘテロプラスミー、モザイク）を検出した後、カスタムレポートのレポートテンプレートを使って専用のレポートを生成し、迅速にテキストファイルやエクセルファイル、VCFファイルでエクスポートすることが可能です。VCFファイルはSoftGenetics社製のNGSヒトバリアント情報管理＆解釈支援ワークベンチGeneticist Assistant（ジェネティシストアシスタント）にインポートできます。Geneticist Assistantではバリアントやアノテーションのヒストリカルナレッジベースを構築できます。これらのカスタムレポートのレポーティングオプションにより、普段使用しているレポート構成や、LIMS、その他のデータベースの仕様に合ったレポートを迅速に作成できます。