Mutation Surveyorソフトウェアの特許技術である「アンチコリレーション」テクノロジーは、サンガーシーケンストレース中の体細胞変異やヘテロプラスミー、モザイク現象に関連する潜在的な低頻度バリアント（5％～）を検出します。サンプルシーケンストレースとリファレンストレースの比較により、サンプルピークとリファレンスピーク間のphysicalな差異を算出して低頻度バリアント候補のポジションをMutationトレースに示します。

アンチコリレーションテクノロジーは、シグナルノイズ比やOverlapping factor、Dropping factorを含むリファレンスと比較したサンプルトレースのphysicalな特徴を評価します。Mutation Surveyorソフトウェアの感度なら、Mutationトレースに算出された小さなMutationピークインテンシティをモニタリングすることによって、プライマリーピークに大きな変化を生じさせない体細胞/低頻度バリアントを検出できます。フォワード・リバース両方のトレースファイルから同じマイナーアレルが検出されると、Mutationトレースのその位置に緑のバーが表示されます。上の図ではTP53遺伝子の5番エクソンに低頻度ピークが検出されています。